在上海市，当工资收入超过5000元时，个人所得税将按照超额累进税率进行扣除。以下是上海工资所得税的计算方式和税率表：1. 工资收入在1至5000元之间，包括5000元，适用个人所得税税率为0%。2. 工资收入在5000至8000元之间，包括8000元，适用个人所得税税率为3%。3. 工资收入在8000至17000元之间，包括17000元，适用个人所得税税率为10%。4. 工资收入在17000至30000元之间，包括30000元，适用个人所得税税率为20%。5. 工资收入在30000至40000元之间，包括40000元，适用个人所得税税率为25%。6. 工资收入在40000至60000元之间，包括60000元，适用个人所得税税率为30%。7. 工资收入在60000至85000元之间，包括85000元，适用个人所得税税率为35%。8. 工资收入在85000元以上，适用个人所得税税率为45%。扣税的具体步骤如下：1. 首先从工资中扣除五险一金。2. 然后减去个人所得税起征点5000元。3. 最后，使用超额累进税率的计算方法套入计算公式。工资薪金包括基本工资、奖金、津贴、补贴、年终加薪、加班工资，以及与员工任职或者受雇有关的其他支出。法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：（一）工资、薪金所得；（二）劳务报酬所得；（三）稿酬所得；（四）特许权使用费所得；（五）经营所得；（六）利息、股息、红利所得；（七）财产租赁所得；（八）财产转让所得；（九）偶然所得。居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。第三条 个人所得税的税率：（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
