NDSL与IDSL的区别主要体现在产地、保修服务、中文界面及兼容性上。IDSL是神游公司发行的行货版本的NDSL，而NDSL则是日本任天堂发售的NDSL。两者在本质上相同，但IDSL具有行货主机的特点，可以享受保修服务，拥有中文操作界面，并能玩专用的大陆版正版DS软件。相反，NDSL作为水货主机，没有保修，没有中文操作界面，不能直接玩大陆正版游戏，但可以通过烧录方式来玩。此外，IDSL的电源为220V，无需变压器即可充电，而NDSL的日本版和美国版等则需使用110V转220V的变压器才能充电。在升级功能上，刷机是一种更改游戏机内部程序的方法，可以使游戏机使用烧录卡进行游戏。然而，IDSL刷过机器后会变成NDSL，因此会失去保修服务。从价格方面看，NDSL的价格在2007年7月时大约在1050元至1200元左右，而IDSL的价格略高几十元。IDSL作为行货版本，质量稳定，不易损坏，且兼容所有版本的游戏，无需额外购买变压器即可充电，而NDSL作为水货版本，价格相对较高，且需要使用变压器充电，主要用于下载游戏而非直接玩大陆正版游戏。
