萨尔纳加的设定
宇宙中存在名为“萨尔纳加”的先进种族，致力于创造“纯粹本质”（星灵）与“纯粹形体”（异虫）。他们选中艾尔（Aiur）的星灵作为继承者，但星灵发展出高度文明后抛弃了卡拉（Khala，精神链接），萨尔纳加失望离开。
随后，萨尔纳加在异虫母星泽鲁斯（Zerus）培育原始异虫，但被异虫反噬。幸存者奥鲁斯（Ouros）化身为“守护者”，暗中引导后续事件。
地球联合理事会（UED）与泰伦联邦
人类源自地球殖民船“超级运输船”的幸存者，建立泰伦联邦。联邦腐败统治引发反抗，阿克图尔斯·蒙斯克（Arcturus Mengsk）组建“克哈之子”组织，利用幽灵特工莎拉·凯瑞甘（Sarah Kerrigan）摧毁联邦首都塔桑尼斯（Tarsonis），并释放异虫制造混乱。
凯瑞甘的背叛
蒙斯克为巩固权力抛弃凯瑞甘，使其被异虫感染。异虫主宰（Overmind）控制虫群进攻星灵母星艾尔，意图吸收星灵的灵能潜力。
艾尔陷落
异虫大举入侵艾尔，星灵大主教塔萨达尔（Tassadar）为拯救同胞，与黑暗圣堂武士泽拉图（Zeratul）合作，牺牲自己摧毁主宰。
流亡与反击
幸存星灵逃至萨古拉斯（Shakuras），在黑暗圣堂武士领袖拉莎加尔（Raszagal）和泽拉图的帮助下，利用萨尔纳加神庙净化星球上的异虫。期间，凯瑞甘为巩固势力杀害拉莎加尔，嫁祸于泽拉图。
异虫内部分裂
主宰死后，凯瑞甘通过灵能控制虫群，成为刀锋女王（Queen of Blades）。她击败UED远征军，并逼迫星灵与人族（吉姆·雷诺的游骑兵）暂时结盟。
查尔之战
蒙斯克、星灵执行官阿塔尼斯（Artanis）和雷诺联手对抗凯瑞甘，但失败。凯瑞甘统治查尔（Char）星系，成为宇宙最大威胁。
亚蒙的阴谋
萨尔纳加中的堕落者亚蒙（Amon）企图毁灭所有生命。他操控星灵领袖阿拉纳克（Alarak）的塔达林派系，并感染星灵卡拉，使大部分星灵陷入疯狂。
三族联合
雷诺救出被净化的凯瑞甘（恢复人类意识），阿塔尼斯联合黑暗圣堂武士切断卡拉，星灵重获自由。最终战役中，三族合力在虚空击败亚蒙，凯瑞甘吸收萨尔纳加力量成为新神，重塑宇宙秩序。
凯瑞甘：以萨尔纳加形态离开，暗示未来可能回归。
雷诺：与凯瑞甘告别后隐居。
阿塔尼斯：领导星灵重建文明，与异虫和人族达成脆弱和平。
牺牲与救赎：塔萨达尔、泽拉图、雷诺等人为信念付出代价。
轮回与进化：萨尔纳加的试验揭示生命必然突破造物者束缚。
剧情通过RTS战役层层展开，辅以小说《星际争霸：黑暗降临之前》等补充细节，构建了宏大的科幻史诗。
