996工作制是违法的，劳动者可以申请劳动仲裁来维护自身权益。
“996”是指劳动者早上9点上班，晚上9点下班，中午和傍晚休息1小时（或不到），每日工作10小时以上，一周工作6天，每周工作60小时以上的工时制度。996工作制涉及工作时间超长的问题，属于劳动争议的范畴。劳动者可以提出以下仲裁请求：确认996工作制违法；要求支付加班费；如果因拒绝996工作制被违法解除劳动合同，可以要求支付违法解除劳动合同的赔偿金。
《中华人民共和国劳动法》第三十六条规定：“国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时，平均每周工作时间不得超过四十四小时的工时制度。”该法第四十一条还规定：“用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。”根据上述法律可知，法律规定的劳动者最长工作时间一般为每日9小时，即使特殊情况下可以达到每日12小时，但每周总计的最长工作时间上限大约计算为53小时。而“996”工作制度下，劳动者每周工作时间达到60小时以上，明显违背法律规定。
劳动者在遭遇超时加班后有多种途径可以进行维权。
第一，劳动者可以向劳动保障行政部门进行投诉。劳动者在遭遇超时加班后可以向劳动保障监察部门进行投诉。劳动保障监察部门受理后，要依法依规进行处理。
第二，劳动者可以向工会反映问题。一方面，根据《劳动法》第四十一条规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但也有严格的时间限制。如果企业安排劳动者超时加班，未经工会和劳动者同意，则工会可以向企业提出异议，进行交涉。另一方面，工会有劳动监督的职能，其监督客体包括用人单位遵守国家有关就业、劳动合同、工作时间和休息休假、工资报酬、履行集体合同等情况。根据《劳动合同法》第七十八条规定，工会依法维护劳动者的合法权益，对用人单位履行劳动合同、集体合同的情况进行监督。用人单位违反劳动法律法规和劳动合同、集体合同的，工会有权提出意见或者要求纠正；劳动者申请仲裁、提起诉讼的，工会依法给予支持和帮助。
第三，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。劳动者可以拒绝超时加班，并可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。用人单位不能以劳动者拒绝超时加班而解除劳动合同。因此而产生争议的，双方当事人可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
《中华人民共和国劳动法》
第三十六条国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
第四十一条用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
