君子堂在九阴真经中应该修炼的主要经脉有：手太阴肺经、手少阳三焦经、足少阳胆经。
1. 手太阴肺经： 此经脉主要关联人体的呼吸系统与免疫系统。 修炼此经脉可以提升气血运行，增强内外防御能力。 对于君子堂弟子而言，强化肺经有助于提升武艺的持久力与实战中的抗击打能力。
2. 手少阳三焦经： 此经脉涉及人体的内分泌与代谢系统。 修炼此经脉有助于调节身体机能，提高身体的灵活性与反应速度。 对于君子堂弟子来说，三焦经的修炼对于提升轻功与反应能力尤为重要。
3. 足少阳胆经： 胆经关乎人体勇气与决断力。 修炼此经脉可以提升武者的胆识与勇气，增强临危不惧的气场。 君子堂弟子修炼胆经，有助于在武林中临危不乱，发挥最高水平的武艺。
