是的，水丘昭券被灭门了。以下从电视剧和历史两个角度进行详细说明：
在电视剧《太平年》的剧情设定里，水丘昭券遭遇了极为惨烈的灭门之祸。何承训按照胡进思的授意，对水丘昭券一家展开了血腥的屠杀。这场灭门行动极为彻底，全家上下无一幸免，就连年幼的孩子也未能逃脱厄运。这种情节设定往往是为了增强故事的冲突性和戏剧性，通过展现如此残酷的事件，凸显出剧中各方势力之间的矛盾冲突以及权力斗争的激烈程度，让观众能够更深刻地感受到剧情的紧张氛围和人物命运的跌宕起伏。
从历史资料来看，水丘昭券确实遭遇了不幸的结局。他与鹿光铉一同遇害，而杀害他们的凶手正是胡进思。虽然历史记载没有像电视剧那样详细描述灭门的具体过程和细节，但可以确定的是，水丘昭券的生命终结于胡进思之手。这一历史事件反映了当时复杂的政治局势和权力争夺。在古代的政治环境中，各方势力为了争夺权力和利益，常常会不择手段，像水丘昭券这样的悲剧可能并非个例。他的遇害可能是因为他卷入了某些政治纷争，或者他的存在对某些人的权力构成了威胁，从而招致了杀身之祸。
无论是电视剧的演绎还是历史的记载，都表明水丘昭券遭遇了悲惨的命运，其家族也遭受了灭顶之灾。这一事件不仅是一个人物命运的写照，也从侧面反映了特定历史时期的社会风貌和政治生态。
