远程导弹袭击对菲律宾的影响主要体现在军事安全、经济与民生、地缘政治、社会与政治四个方面。
军事安全上，一是美军基地成为潜在目标。菲律宾境内9处美军营地部署了“战斧”巡航导弹和“海马斯”火箭炮等进攻性武器，可能被伊朗或其代理人视为打击对象，即便伊朗导弹直接射程不足，也可通过潜艇、无人艇或代理人网络威胁美军设施及周边区域。二是防御能力薄弱，菲律宾缺乏先进反导系统，若遭遇袭击，可能面临“被夷为平地”的风险。
经济与民生方面，一方面中东地区200万菲律宾劳工的侨汇占GDP近10%，冲突可能导致撤侨困难和经济损失。另一方面，全球油价因霍尔木兹海峡局势飙升，菲律宾作为能源进口国面临通胀压力；红海袭击导致菲律宾海员伤亡，影响航运业，因为菲海员占全球25%。
地缘政治上，马科斯政府开放基地、部署导弹，被指责将菲律宾绑上美国战车，加剧与周边国家的紧张关系，且菲律宾可能因美军存在成为冲突“附带损伤”，失去战略中立地位。
社会与政治上，前总统之子保罗·杜特尔特等批评者警告“美军基地将国家变为靶心”，引发民众恐慌与抗议，质疑政府亲美路线。同时，菲律宾在联合国呼吁和平，但难以摆脱美国影响，陷入外交被动的两难境地。总体而言，远程导弹袭击的直接威胁虽有限，但美军存在及地缘博弈使菲律宾面临安全、经济和政治多重风险。
