1971年7月至1986年2月，周福启先生在山东省金乡县担任县委宣传工作队队员，随后在公社党委办公室任职，金乡县团委和县委办公室秘书。他在这一阶段还曾在山东省济宁地（市）委组织部担任秘书科秘书、干部科干事，最终晋升为科长，并于1981年2月至1983年3月在山东济宁师范专科学校攻读汉语言文学专业。1986年2月至1991年11月，周福启先生晋升为山东省济宁市委组织部副部长，之后成为副部长兼市委组织员办公室主任，期间曾被借调至中组部地方干部局工作。1991年11月至1999年9月，他在中央组织部地方干部局担任干部、三处副处长，之后升任处长，并在1994年至1998年间进一步发展为副局级调研员兼处长。在此期间，他还参加了中央党校的省部级干部进修班和中国社科院研究生院的在职研究生课程班学习。1999年9月至2000年6月，周福启先生担任中央组织部地方干部局副局长。此后，他在2000年6月至2003年12月间，晋升为中央组织部干部一局副局长，并在此职务上积累了丰富的经验和专业资格，包括在北京大学政府管理学院获得管理学硕士学位。2003年至2007年，他担任正局级调研员、巡视员和副局长，且在2003年还担任过中央党校中青年干部培训班联络员组组长。2007年12月至2008年1月，他负责中央组织部机关人事局的工作。随后，他成为机关党委（人事局）的常务副书记（局长）。在2009年至2011年，他担任中央纪委驻国家安全生产监督管理总局纪检组组长，同时也是总局的党组成员。2011年10月后，他转任中央直属机关工作委员会的副书记和纪工委书记。2012年11月，周福启先生当选为中国共产党第十八届中央纪律检查委员会常务委员会委员。
