《碟中谍5：神秘国度》讲述了IMF面临解散危机时，伊森·亨特揭露并对抗恐怖组织“辛迪加”，在全球多地展开惊险行动，最终坚持对朋友的忠心并完成不可能任务的故事。具体剧情如下：
IMF面临解散危机：从事卧底任务的IMF（不可能任务情报署）已成为众矢之的，当最可怕的威胁“辛迪加”正在酝酿时，他们竟面临全面解散的危机。“辛迪加”是一个坚不可摧、由一群受过精良训练的叛逃间谍组成的组织，他们企图瓦解文明世界的基础。
伊森·亨特揭露威胁：在间谍世界里，“辛迪加”长期以来只被视为空穴来风，但伊森·亨特揭露了众人不愿面对的现实，他发现这个秘密组织真的存在。如果再不行动，“辛迪加”将会在全球引爆一连串灾难。然而，中情局不肯相信伊森·亨特的说法。此时，伊森·亨特自己的团队命运也岌岌可危，但在尽所有努力之前，他绝不会放弃。
全球多地展开行动：
维也纳行动：伊森·亨特在维也纳的歌剧院执行任务时，遭遇了“辛迪加”的伏击。他凭借出色的身手和应变能力，在危急时刻从容不迫地脱身，但任务并未完全成功，还引发了后续的连锁反应。
卡萨布兰加追击：为了追踪“辛迪加”的线索，伊森·亨特前往卡萨布兰加。在那里，他与团队成员紧密合作，与敌人展开了一场惊心动魄的追击战。
军机上的生死较量：在一架军用飞机上，伊森·亨特与“辛迪加”的首领展开了一场生死较量。他利用自己的技巧和智慧，在飞机上与敌人周旋，最终成功制服敌人，但自己也陷入了深水危机。
深水危机：在逃脱过程中，伊森·亨特被迫跳入海中，面临深水危机的考验。他凭借顽强的毅力和出色的潜水技能，成功摆脱了敌人的追捕。
坚持对朋友的忠心：在整个过程中，伊森·亨特不仅面对着来自“辛迪加”的威胁，还面临着团队内部的信任危机。但他始终坚持对朋友的忠心，与团队成员紧密合作，共同对抗敌人。
完成不可能的任务：经过一系列惊心动魄的行动，伊森·亨特最终揭露了“辛迪加”的真相，并成功阻止了他们的阴谋。他达成了最具意义的任务：坚持对朋友的忠心，并继续创造不可能的理想。
