火影手游密卷主要通过小队突袭、活动获取，70级可在死亡沼泽刷天机秘卷，75级后推荐去蛮荒。具体如下：
玩家在通过副本3-2后解锁小队突袭玩法，通过完成小队突袭内的任务可获得相应的密卷碎片。收集到足够的密卷碎片之后即可解锁相应密卷。
小队突袭会消耗铜币，突袭7、8次后将消耗数万铜币，消耗铜币金额达到数十万之后继续突袭就不划算了。
小队突袭可以匹配队友也可以组织邀请，被邀请的玩家不能获得密卷碎片，但可以获得物品令牌。
部分密卷在小队突袭中有几率获得碎片，例如阴愈伤灭（俗称霸体）在小队突袭有几率获得碎片，够15碎片后可以激活此卷轴。开三倍小队突袭会有较大的几率出阴愈伤灭的碎片。小队突袭困难模式中的纲手和大蛇丸副本才有几率掉落风杀阵碎片。
疾风传之前的秘卷都可以通过小队突袭获得，而疾风传新秘卷只能通过活动获得。例如三周年时可以在火影之路领一个密卷，玩家可以根据自己的需求选择。
活动中的秘卷礼包也有一定几率抽到密卷碎片，不过可能需要购买，且价格可能较为昂贵。
