《终极笔记》大结局中张家古楼每个人的结局以及三叔铺子地下的秘密如下：
张家古楼每个人的结局： 黑瞎子：短暂失踪，拥有不老体质，未参与张家古楼的行动但在剧中有所表现。 小花：在张家古楼遇险后伤势严重，被送到美国治疗，两个多月后回到北京。 霍仙姑：进入张家古楼后遭遇强碱物质导致死亡，头颅被吴邪带出古楼。 霍秀秀：因霍仙姑的信继任霍家当家。 潘子：在张家古楼身亡，为了帮助吴邪通过六角铜铃阵，最后一颗子弹留给了自己。 裘德考：追求长生未果，从巴乃回来后活了三个月去世。 铁三角：胖子留在巴乃守候云彩；吴邪带上三叔的面具，后被迫说出真实身份；小哥回到青铜门。
三叔铺子地下的秘密： 吴邪在三叔铺子地下发现了一个房间，摆满了空的录像带。 房间内有与三叔房间相似的电脑，且密封性好，能听到楼上声音但外面听不到里面声音。 吴邪曾被“那个人”封在这个房间，并通过邮件交谈，得知关于“它”的事情。 这个秘密区域与巴乃考古队被掉包的事件有关，那口被掉包的棺材被送到了这里。 住在三叔房子地下的人是解连环，他当年西沙假死，之后一直和吴三省共用一个身份。 信中提到，“它”组织已经消失，解连环终于可以重见天日，但吴三省的去向仍然未知。
