年底双薪计算个人所得税需将其与工资薪金合并计税，具体操作流程及要点如下：
年底双薪属于工资薪金的一部分，根据现行个人所得税法规定，应与当月工资薪金合并，按“综合所得”计征个人所得税。合并后的收入扣除基本减除费用（5000元/月）、专项扣除（如社保、公积金）、专项附加扣除（如子女教育、房贷利息等）及其他依法确定的扣除项目后，计算应纳税所得额，再对应适用税率表计算税款。
登录系统打开“自然人电子税务局(扣缴端)”，输入账号密码完成登录。
选择申报模块在首页点击“综合所得申报”，进入申报界面。
填写工资薪金数据
选择“正常工资薪金所得”，点击“填写”按钮。
点击“添加”或“导入”，录入员工信息及收入数据。
关键操作：将年底双薪金额直接填入“本期收入”栏，与当月工资合并计算。例如，员工当月工资8000元，年底双薪10000元，则“本期收入”填写18000元。
系统自动计算税款保存数据后，点击“税款计算”，系统会根据合并后的收入自动扣除各项费用（如5000元起征点、专项扣除等），并按照综合所得税率表计算应纳税额。
假设员工当月工资8000元，年底双薪10000元，社保及公积金扣除1500元，无其他扣除项目：
通过上述流程，即可准确完成年底双薪的个人所得税计算与申报。
